张红宇，女，博士，副教授，硕士生导师。1999年毕业于烟台师院生物学专业，2002年获得四川农业大学作物遗传育种专业硕士学位（研究方向：水稻基因工程；指导教师：周开达院士，吴先军副研究员，唐克轩教授（复旦大学）），2006年获得四川农业大学作物遗传育种博士学位（研究方向：水稻表观遗传；指导教师：汪旭东研究员，吴先军教授）。2009-2010年赴澳大利亚CSIRO Plant Industry访问研究（研究方向：种子发育的表观遗传研究，合作者：Ming Luo博士）。2002年至今，在四川农业大学主要从事水稻基因组学、水稻表观遗传学以及种子发育等相关方面的研究。近年来在《Front》《JEXBOT》《Rice》《JGG》等杂志上以第一作者或通讯作者发表文章19篇（其中SCI收录10篇，单篇最高影响因子5.79，累计影响因子33.712）。参与选育水稻新品种14个，实用新型专利5项，全国商业科技进步奖二等奖1项。培养毕业硕士研究生7名，协助指导毕业研究生10余名。
招生专业
作物遗传育种
研究方向
主要从事水稻表观遗传、种子发育的分子机理、基因工程育种和杂交水稻亲本创制研究，主要工作包括：
1. 利用周开达院士发掘的无融合生殖水稻中分离出的不同倍性材料，研究表观基因组、甲基化组和基因表达的关系，为栽培稻进化的表观调控机制和多倍体杂交早代稳定的解析奠定了基础。
2. 通过异倍性杂交和胚乳发育研究，发现印记基因在种子败育中起着重要作用，物种在进化过程中形成了基因组印记，绕开印记可能是无融合生殖的选择途径。
3. 种子发育相关基因研究。首次克隆到了编码线粒体膜蛋白的核基因，与种子败育相关；从多倍体水稻中发现了基因的印记方式发生改变，并与种子大小相关；从水稻突变体中发现了与种子灌浆速率相关的新基因。克隆蔗糖转化酶基因并分析其家族成员之间的互作关系，通过抑制淀粉转运以及与抑制基因互作产生小籽粒。
4. 水稻耐寒非生物胁迫基因研究。利用耐寒植株分析主效基因与甲基化调控的关联，研究部分耐寒基因的功能。
承担课题
1.运用基因编辑技术提高稻米直链淀粉含量，教育部春晖计划，2018-2020，在研，主持。
2.一个水稻灌浆延长和籽粒大小基因的克隆和功能研究，省科技厅（国际合作），2018.12，结题，主持。
3.水稻二倍体和四倍体杂交的胚乳发育和印记基因分析，国家自然科学基金（青年基金），2016.12，结题，主持。
4.倍性水稻正反交后代胚乳中印记基因的表达和功能分析，省教育厅（应用基础），2014.12，结题，主持。
5.水稻不同倍性表达基因的DNA甲基化遗传模式研究，省教育厅（应用基础），2011.12，结题，主持。
6.耐热基因TT1功能验证及其在水稻中育种价值分析，农业部（转基因专项），2010.12，结题，主持。
7.水稻功能基因组研究，省科技厅（应用基础），2009.12，结题，主持
学术论文
1.Xiaoshu Deng#, Xiaohang Han#, Shicong Yu, Zhijian Liu, Daiming Guo,Yao He, Wenyi Li, Yu Tao, Chaowei Sun, Peizhou Xu, Yongxiang Liao, Xiaoqiong Chen, Hongyu Zhang*, and Xianjun Wu*. OsINV3 and Its Homolog, OsINV2. Control Grain Size in Rice. 2020, 21, 2199; doi:10.3390/ijms21062199(IF=4.18)
2.Hui Guo, Tingkai Wu, Shuxing Li, Qiang He, Zhanlie Yang, Wuhan Zhang, Yu Gan, Pingyong Sun, Guanlun Xiang, Hongyu Zhang*, and Huafeng Deng* . The Methylation Patterns and Transcriptional Responses to Chilling Stress at the Seedling Stage in Rice. International Journal of Molecular Sciences. 2019, 20, 5089; doi:10.3390/ijms20205089(IF=4.18)
3.Hongyu Zhang#, Asif Ali#, Feixue Hou, Tingkai Wu, Daiming Guo, Xiufeng Zeng, Fangfang Wang, Huixia Zhao, Xiaoqiong Chen, Peizhou Xu and Xianjun Wu*，Effects of ploidy variation on promoter DNA methylation and gene expression in rice，BMC Plant Biology，2018，https://doi.org/10.1186/s12870-018-1553-5(IF=3.67)
4.侯飞雪,彭永彬,韩小行,白鹊,顾朝剑,孙朝伟,何曜, 张红宇*.水稻穗顶退化突变体 paa1331 的鉴定及基因定位.科学通报，2018，63(31):3192-3203.
5.张红宇#，崔晓云#，侯飞雪，王一伊，吴挺开，刘禹彤，杨定乾，张洪凯，傅瑶，张向阳，李文丽，吴先军*.水稻基因组加倍对籽粒大小调控基因表达的影响，遗传，2016, 38(12):1102-1113.
6.杜康兮，江青山，徐培洲，韩保林，彭永彬，傅瑶，吴挺开，赵德明，陈家彬，陈晓琼，张红宇*，吴先军*. 水稻籽粒灌浆突变体gef1的鉴定及其基因定位.科学通报. 2016, 61(25):2800-2810.
7.Hong-Yu Zhang, Hui-Xia Zhao, Shao-Hua Wu, Fang Huang, Kai-Ting Wu, Xiu-Feng Zeng, Xiao-Qiong Chen, Pei-Zhou Xu, Xian-Jun Wu*. Global Methylation Patterns and Their Relationship with Gene Expression and Small RNA in Rice Lines with Different Ploidy.Front. 2016, 7:1002. doi: 10.3389/fpls.2016.01002(IF=4.495)
8.Hong-yu Zhang, Ming Luo, Susan D. Johnson, Xiao-wei Zhu, Lei Liu, Fang Huang, Yu-tong Liu,Pei-zhou Xu, Xian-jun Wu*. Parental genome imbalance causes post-zygotic seed lethality and deregulates imprinting in rice. Rice, 2016, 9 (1): 43. doi: 10.1186/s12284-016-0115-4(IF=5.79)
9.Hongyu Zhang, Yutong Liu, Mipeng Han, Limei Wu, Zhijian Liu, Xiaoqiong Chen, Peizhou Xu, Xianjun Wu*. The Effects of DNA Methylation on the Expression of Non-imprinted Genes in Rice.J Rice Res2016, 4:168. doi:10.4172/2375-4338.1000168(IF=1.18)
10.Hongyu Zhang, Ming Luo, Robert Day, Mark J. Talbot, Aneta Ivanova, Anthony R. Ashton, Abed M. Chaudhury, Richard MacKnight, Maria Hrmova, Anna M. Koltunow* . Developmentally regulated HEART STOPPER, a mitochondrially targeted L18 ribosomal protein gene, is required for cell division, differentiation and seed development in Arabidopsis.Journal of Experimental Botany, 2015,66(19):5867-5880. (IF=3.417)
11.吴丽梅,朱晓炜,崔晓云,刘志坚,刘禹彤,徐培洲,陈晓琼,吴先军, 张红宇*.调控水稻异倍性杂交种子败育的相关基因分析.科学通报, 2015, 60(17): 1592-1601.
12.Yonghang Tian, Hongyu Zhang, Peizhou Xu, Xiaoqiong Chen, Yongxiang Liao, Baolin Han, Xiangbin Chen, Xiangdong Fu, Xianjun Wu*. Genetic mapping of a QTL controlling leaf width and grain number in rice.Euphytica, 2015, 202:1–11. DOI 10.1007/s10681-014-1263-5
13.Hongyu Zhang, Abed Chaudhury, Xianjun Wu*.Imprinting in Plants and Its Underlying Mechanisms.Journal of Genetics and Genomics, 2013, 40(5): 239-247(IF=2.924)
14.Luo M, Taylor JM, Spriggs A, Zhang H, Wu X, et al. A Genome-Wide Survey of Imprinted Genes in Rice Seeds Reveals Imprinting Primarily Occurs in the Endosperm.PLoS Genetics, 2011,7(6): e1002125. doi:10.1371/journal.pgen. 1002125 (IF =8.69)
15.Aihua Wang, Damien Garcia, Hongyu Zhang, Ke Feng, Abed Chaudhury, Fred Berger, W. James Peacock, Elizabeth S. Dennis, Ming Luo * . The VQ motif protein IKU1 regulates endosperm growth and seed size in Arabidopsis.Plant Journal, 2010, 63: 670-679（IF =6.94）
16.张红宇，徐培洲，杨华，吴先军*.拟南芥的印记基因和印记表达调控. 遗传, 2010,32(7):670-676.
17.张红宇,彭海,吴绍华,黄静,徐培洲,汪旭东,吴先军*.双胚苗水稻中单倍体和二倍体不同器官的cDNA-AFLP分析. 遗传, 2009,31(3): 305-310.
18.张红宇,杨富云,高梅,徐培洲,张全芳,徐建第,吴先军*. PiA水稻悬浮细胞系的建立.生物工程学报, 2009,25(03): 425-427.
19.张红宇,彭海,李平川,邓其明,徐培洲,李云,汪旭东,吴先军*.运用RT-PCR方法对双胚苗水稻中单倍体和对应二倍体的芯片数据的器官特异性分析. 自然科学进展, 2008, 18(8): 946-950.
20.Zhang H Y, Peng H, Li P C, Deng Q M, Xu P Z, Li Y, Wang X D, Wu X J*. The microarray analysis for gene expression in haploids and diploids derived from twin-seedling rice. Sci China Ser C, 2008, 51(6): 503-512(IF=2.297).
21.Peng H#, Zhang H Y#, LI Y, Xu P Z, Wang X D, Wu X J*. Natural homologous triploidization and DNA methylation in SARII-628, a twin-seedling rice (Oryza sativa L.).Rice Sci, 2007, 14(4): 265-271.
22.Zhang H Y, Peng H, Li Y, Xu P, Wang X, Wu X J. Patterns of DNA cytosine methylation between haploids and corresponding diploids in rice.Chinese Sci Bull, 2006, 51(14): 1721-1728 (IF=1.579).
23.张红宇,吴先军,唐克轩,汪旭东,孙小芬,周开达*. 半夏凝集素基因(pta)导入水稻及其表达的初步研究. 遗传学报, 2003,(11) :1013-1019.
审定品种
1. 川康优583，渝审稻20200002，省部级，2020.06，排名第4
2. 蓉7优313，国审稻20190058，国家级，2019.10，排名第4
3. 川优536，川审稻20190003，省部级，2019.07，排名第4
4. 内优6183，川审稻20180005，省部级，2018.07，排名第4
5. 广8优3711，桂审稻2018039，省部级，2018.05，排名第3
6. 内优683，渝审稻2016003，省部级，2016.05，排名第4
7. 蜀优217，国审稻2015013，国家级，2015.08，排名第2
8. 蜀优727，川审稻2015016，省部级，2015.08，排名第3
9. 润优318，渝审稻2015003，省部级，2015.05，排名第4
10. 内6优538，国审稻2014010，国家级，2015.01，排名第14
11. 川谷优918，国审稻2013004，国家级，2013.10，排名第10
12. 广优498，国审稻2013009，国家级，2013.10，排名第13
13. 内香6优498，国审稻2013007，国家级，2013.10, 排名第13
14. 川农优298，国审稻2012004，国家级，2013.01，排名第12
授权专利
1.一种控制水稻叶片衰老的基因及其编码的蛋白质，2019，CN110229801A，廖泳祥，吴先军，向兵，白鹊，郭岱铭，何曜，徐培洲，张红宇，陈晓琼，刘禹彤.
2. 一种水稻早花时相关蛋白及其编码基因，2018，CN108003227A，徐培洲，吴挺开，陶宇，孙朝伟，吴先军，张红宇，陈晓琼，廖泳祥，邓小书，余世聪.
3. 一种水稻白叶枯病抗性相关基因OsABA2及其应用，2017，CN107475210A，廖泳祥，徐培洲，吴先军，张红宇，陈晓琼，王文明，吴挺开，彭永斌，白鹊，何曜.
4.一种水稻穗顶退化相关蛋白激酶及其编码基因，2017，CN107937363A，彭永斌，侯飞雪，白鹊，徐培洲，吴先军，张红宇，陈晓琼，廖泳祥，顾朝剑，韩小行.
5.一种水稻两系不育系繁殖制种的方法，2016，CN106386312A，徐培洲，吴先军，张红宇，陈晓琼，廖泳祥，彭永斌，刘禹彤，吴挺开，傅瑶，顾朝剑，郭岱铭.
科技奖项
广适高产优质杂交稻泰优99选育及推广，全国商业科技进步奖二等奖，2016.12.13，排名第三。
联系方式
1. 联系电话：13518156138
2. E-mail：zhanghysd@163.com
